45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2445 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  191  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  32.58 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  31.87 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  35.79 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  33.68 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  33.7 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  32.61 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  35.56 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  29.9 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  32.97 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  30.11 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  26.97 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  31.18 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  40.66 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0388  hypothetical protein  29.49 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  30.67 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  24.69 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  28.38 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  22.99 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  30.56 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  27.63 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  28.89 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  22.99 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  22.99 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  27.63 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  23.6 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  28.21 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  27.47 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  29.85 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  31.51 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0787  YCII-related  32.22 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  27.06 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  31.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  25.84 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  25 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  29.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  29.17 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  24.72 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  28.24 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  30.99 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  32.26 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  26.92 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  27.4 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  25.84 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>