93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0787 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0787  YCII-related  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  41.94 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23070  hypothetical protein  38.37 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.851112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  35.48 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  35.48 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  35.48 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  34.41 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  34.83 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  31 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  34.83 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  36.36 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  33.66 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  29.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  29.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  29.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  29.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  29.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  35.35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  31.37 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  29.17 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  32.26 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  32.32 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  34.38 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  31.31 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  34.25 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  34.25 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  32.32 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  33.33 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  29.17 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  30.3 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  32.97 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  32.58 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  30.3 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  31.31 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  40.74 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  30.3 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  29.29 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  31.31 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  32.58 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  31.46 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  32.29 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  31.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  31.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  29.29 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  34.09 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  28.28 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  34.83 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  34.83 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  29.03 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  31.31 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  31.31 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  29.59 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  34.83 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  29.29 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  29 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  26.04 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  34.52 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  28.12 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  32.95 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  31.31 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  32.22 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  32.94 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  29.29 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  27.27 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  34.83 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  30.3 
 
 		 99 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  29.21 
 
 		 100 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  29.17 
 
 		 98 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  32.93 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  32.32 
 
 		 99 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  32.94 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42277  hypothetical protein  31.76 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.047688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  32.32 
 
 		 99 aa  40.8  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  32.58 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  28.57 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  27.27 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  34.15 
 
 		 95 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>