32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2220 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  100 
 
 
89 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  80.9 
 
 
89 aa  156  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  70.79 
 
 
89 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  73.03 
 
 
89 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0544  YciI-like protein  67.42 
 
 
89 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0898  YciI-like protein  52.81 
 
 
89 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  50.56 
 
 
89 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  49.44 
 
 
89 aa  103  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  49.44 
 
 
89 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0992  YciI-like protein  49.44 
 
 
89 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05771  YciI-like protein  47.19 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  47.19 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  46.07 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0574  YciI-like protein  42.7 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.546238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06301  YciI-like protein  44.94 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  37.65 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  31.4 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  32.58 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  28.24 
 
 
97 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  29.41 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  26.92 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  28.95 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  34.85 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  27.06 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  27.14 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  28.12 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  26.44 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  28.74 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  27.08 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  24.72 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  31.4 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>