64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2180 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  100 
 
 		 98 aa  191  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  52.53 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2893  YCII-related  50.54 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027258  hitchhiker  0.000787239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  47.83 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  47.96 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  48.96 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1403  YCII-related protein  43.48 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  45.26 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  44.79 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8035  YCII-related protein  44.68 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1250  YCII-related  41.24 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.27136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  38.3 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4142  YCII-related  46.24 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02200  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  31.18 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  38.1 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  32.58 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  37.29 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  35.71 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  31.52 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  35.56 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  33.75 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  33.75 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  28.71 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  32.53 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  34.94 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  34.83 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0565  YCII-related protein  32.95 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  31.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  37.63 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  32.5 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  43.24 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  38.64 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  32.5 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  31.25 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  32.5 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  32.53 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  31.46 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  31.46 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  34.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  36.14 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  33.71 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  30.23 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  36.14 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  27.59 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  31.71 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  33.72 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  31.76 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  31.03 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  31.33 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  29.89 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  31.03 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  38.1 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  30.67 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  29.89 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  28.74 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  28.74 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  28.74 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  28.74 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  28.74 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  32.65 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  28.74 
 
 		 99 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>