63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1098 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  56.7 
 
 		 103 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  55.67 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  54.64 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  54.64 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  54.64 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  54.64 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  53.19 
 
 		 103 aa  103  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  54.64 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  45.26 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  34.44 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  38.95 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  36.67 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  32.61 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  30.85 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  30.85 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  33.33 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  42.55 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  34.78 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  35.11 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  32.22 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  35.11 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  32.22 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  31.91 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  33.33 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  34.41 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  38.3 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  32.26 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  31.82 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  41.03 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  34.83 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  33.68 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  30.68 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  32.91 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  30.49 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  31.18 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  28.72 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  29.17 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  29.55 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  35 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  34.04 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  34.67 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  32.14 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  33.72 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  30.1 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  30 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  34.38 
 
 		 92 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  26.8 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  34.38 
 
 		 92 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  25.77 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  25.81 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  46.51 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  26.8 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  24.72 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  27.84 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  23.4 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  23.4 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  23.4 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  24.47 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  24.47 
 
 		 109 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>