30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4693 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  100 
 
 		 115 aa  233  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  38.03 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  42.03 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  33.75 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  33.77 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  37.68 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23070  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.851112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  41.18 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  36.05 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  36.62 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  35 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  33.77 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  35.44 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  35.53 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  28.24 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  38.89 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  32.14 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  28.28 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  32 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  27.45 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  28.57 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  28.92 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  33.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  34.21 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  34.21 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  33.33 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  34.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  30.3 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  26.47 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  32.5 
 
 		 103 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>