150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0115 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  100 
 
 		 93 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  54.02 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  52.87 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  50 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  48.28 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  43.96 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  43.82 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  42.53 
 
 		 90 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  52.81 
 
 		 96 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  43.82 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  42.53 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  42.53 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  44.94 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  51.69 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  51.69 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  48.28 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  37.78 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  48.28 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  35.11 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  36.17 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  42.86 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  42.71 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  35.11 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  39.13 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  35.11 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  43.43 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  39.53 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  42.55 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  36.26 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22780  YciI-like protein  45.74 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.064842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1924  YciI-like protein  45.74 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0914031  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  35.11 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  42.86 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  34.04 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  43.62 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  44.68 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  35.48 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  41.24 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  36.05 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  40.43 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  39.36 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  40.43 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  39.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  39.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  39.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  39.36 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  39.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  39.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  39.36 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  43.62 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  37.11 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  41.94 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  34.04 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  41.49 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  39.76 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  36.17 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  36.17 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  36.17 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  36.17 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  36.17 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  40.86 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  34.52 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  40.86 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  38.54 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  38.3 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  38.54 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  38.54 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  38.54 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  38.54 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  40.86 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  38.64 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  36.08 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  31.18 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4679  YciI-like protein  42.86 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189989  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  34.38 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  38.3 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  39.33 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  34.21 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  38.71 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  34.12 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  42.86 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  37.23 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  34.41 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  35.11 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  34.38 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  38.3 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  38.71 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  34.69 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  34.69 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  34.34 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  38.3 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  34.18 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  36.17 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>