123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3906 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  208  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  65.35 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  61 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  61 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  60 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  60 
 
 		 103 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  59 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  59 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  53.19 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  47.42 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  40.21 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  38.14 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  40.21 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  37.5 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  37.63 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  35.05 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  43.3 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  41.49 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  41.49 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  38.04 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  43.18 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  40.22 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  43.01 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  40.21 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  38.95 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  38.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  38.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  37.89 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  33.33 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  32.29 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  42.17 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  33.66 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  42.05 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  34.04 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  31.46 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  35.05 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  30 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  42.05 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  35.23 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  31.31 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23070  hypothetical protein  30 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.851112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  33.7 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  34.15 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  31.52 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  36.46 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  30.43 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  34.09 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  30 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  34.07 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  28.12 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  33.68 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  32.61 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  32.29 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  53.49 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  53.49 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  53.49 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  27.96 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  31.63 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  40.28 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  30.43 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  29.9 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4693  YCII-related  35.44 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  30.68 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  30.43 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  29.21 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2904  YCII-related  29.59 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.087124  normal  0.332831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  32.5 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  41.3 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1975  YciI-like protein  27.37 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  43.59 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  30.21 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  32.29 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  37.63 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1485  YciI-like protein  31.25 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00728644  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  25.25 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  31 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  28.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  28.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  28.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  28.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>