65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3760 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  68.37 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4679  YciI-like protein  68.37 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189989  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  55.1 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  42.53 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  38.89 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  38.46 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  37.8 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  38.37 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  38.3 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3696  YciI-like protein  39.78 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  32.1 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  36.59 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  29.55 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4017  YciI-like protein  37.63 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  36.59 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  36.59 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  34.52 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  31.82 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  35.11 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1818  YciI-like protein  37.89 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0636505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1890  YciI-like protein  37.89 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0972  YciI-like protein  38.64 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  34.09 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  30.68 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2963  YciI-like protein  38.95 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  29.55 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  35.48 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  31.82 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1098  hypothetical protein  29.17 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  32.58 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0115  YCII-related  39.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.011377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  38.89 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  30.95 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  30.85 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1945  YCII-related  31.63 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  32.63 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2186  YCII-related  31.63 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.054491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  29.27 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  29.35 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  25.93 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  34.02 
 
 		 99 aa  40.8  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4142  YciI-like protein  34.74 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  28.4 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  31.25 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  30.95 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  29.9 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  21.98 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  29.59 
 
 		 100 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>