46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47865 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  100 
 
 		 159 aa  326  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  44.32 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  43.33 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  37.63 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  38.46 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  39.56 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  38.46 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  35.48 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  37.36 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  37.23 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  37.23 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  37.23 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  34.38 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  34.41 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  34.74 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  36.17 
 
 		 95 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2220  YciI-like protein  31.4 
 
 		 89 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  35.87 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  35.87 
 
 		 98 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  37.78 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  30.77 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1517  YciI-like protein  29.07 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.26528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  32.98 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  27.91 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06391  YciI-like protein  31.4 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  36.17 
 
 		 97 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  30.23 
 
 		 89 aa  44.3  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  33.68 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  32.53 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  29.17 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06281  YciI-like protein  31.03 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2684  YCII-related  30.53 
 
 		 98 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.112307  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  32.63 
 
 		 98 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18181  YciI-like protein  27.91 
 
 		 89 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0640598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  29.17 
 
 		 101 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  31.11 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0009  YciI-like protein  29.89 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06001  YciI-like protein  27.91 
 
 		 89 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  33.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  30.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  26.04 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  26.04 
 
 		 99 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  32.65 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  30.12 
 
 		 98 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>