88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2752 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  97.92 
 
 		 96 aa  190  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  92.71 
 
 		 96 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  92.71 
 
 		 96 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  91.67 
 
 		 96 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  89.58 
 
 		 96 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0468  YCII-related protein  89.58 
 
 		 96 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  77.08 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  77.08 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  77.08 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  64.52 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  63.44 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  60.87 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1981  YCII-related protein  45.56 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  41.76 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2620  YCII-related  48.86 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0089  YCII-related  43.68 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  41.49 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2508  YCII-related  42.39 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  40.66 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  41.76 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  44.44 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  41.98 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  41.98 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  43.21 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  41.98 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0916  YCII-related  42.53 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  41.76 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  40.66 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  40.66 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  40.66 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24840  hypothetical protein  47.5 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1926  YCII-related  46.15 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0757  YCII-related protein  40.23 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00179224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  39.08 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  41.76 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  47.25 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3417  GTP cyclohydrolase II  38.2 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  42.35 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  42.35 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2497  YCII-related  40.23 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  47.25 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3299  YCII-related protein  34.78 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  43.02 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  42.35 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1762  YCII-related  32.61 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2457  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2510  YCII-related  33.33 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0553875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  37.04 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  32.1 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  30.86 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  31.25 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  33.33 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31170  hypothetical protein  38.82 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.814554  normal  0.945113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0139  YCII-like protein  40 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  31.87 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1210  GTP cyclohydrolase II  36.59 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.732067  normal  0.254823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6921  YCII-related protein  43.55 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2992  YCII-related protein  30.77 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0660  hypothetical protein  30.77 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  29.11 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0504  hypothetical protein  36.26 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1351  hypothetical protein  31.51 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4873  hypothetical protein  28.89 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0987  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000944025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3292  hypothetical protein  28.89 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  36.76 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  36.71 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  27.78 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1540  YCII-related protein  32.93 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  33.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3217  hypothetical protein  36.07 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4943  hypothetical protein  36.07 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1280  YCII-related protein  26.92 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1417  hypothetical protein  25.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  29.76 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2445  hypothetical protein  29.17 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5356  hypothetical protein  28.21 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  31.58 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20150  hypothetical protein  35.38 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.407801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2366  YCII-related protein  34.43 
 
 		 98 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>