39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0504 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0970  YCII-related protein  53 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1877  hypothetical protein  52.75 
 
 		 92 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3244  YCII-related  32.97 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0114  hypothetical protein  36.47 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0129  hypothetical protein  33.7 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3929  YCII-related protein  32.97 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0556  YCII-related  35.16 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0328033  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2489  YCII-related  34.44 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1676  YCII domain-containing protein  34.44 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000604695  normal  0.185637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2391  YCII domain-containing protein  34.44 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3346  YCII-related  30.77 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1923  YCII-related  30 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.821027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0288  YCII-related  31.87 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2861  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3186  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0519  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1434  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0158  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0501  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0684  YCII-related domain-containing protein  31.87 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.906531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2835  YCII-related  35.16 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2222  YCII-related  35.16 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2892  YCII-related  36.26 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6165  YCII-related protein  35.16 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0437  YCII-related domain-containing protein  31.87 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2752  YCII-related  36.26 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4160  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2846  YCII-related  34.07 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  31.76 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  27.66 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2728  YCII-related  32.89 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2373  YCII-related  30.38 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1883  YCII-related  28.42 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113856  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  35.06 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1394  YCII-related  35.82 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5251  YCII-related  29.49 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000875339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  26.44 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  26.44 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>