29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1599 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1599  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.32365  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0886  hypothetical protein  71.59 
 
 
88 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1796  hypothetical protein  62.07 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764017  hitchhiker  0.00919665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3667  YCII-like protein  64.77 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1294  YCII-related protein  64.77 
 
 
88 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1263  YCII-related  63.64 
 
 
88 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4419  hypothetical protein  63.64 
 
 
88 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4011  YCII-related  38.16 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16361  hypothetical protein  38.36 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2015  hypothetical protein  31.96 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16931  hypothetical protein  37.14 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.476637  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17051  hypothetical protein  32.61 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1079  hypothetical protein  36.17 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19541  hypothetical protein  36.17 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17171  hypothetical protein  31.52 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.321834  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1605  hypothetical protein  30.43 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1926  YCII-related  31.82 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0823  YCII-related  33.33 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00411104  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00344  hypothetical protein  28.36 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00356549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1746  YCII-related  28.36 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.333577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5221  YCII-related  30.43 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2257  YCII-related protein  30.77 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01991  hypothetical protein  30.88 
 
 
115 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0327  hypothetical protein  32.99 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2658  YCII-related  23.29 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.978199  normal  0.505193 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3800  YCII-related  29.85 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3913  YCII-related  29.85 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23561  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.202384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2002  YCII-related  28.79 
 
 
98 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000615778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>