67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2132 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  100 
 
 		 96 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  96.88 
 
 		 96 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  95.83 
 
 		 96 aa  159  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  76.34 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  74.19 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  74.19 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  74.19 
 
 		 97 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  74.19 
 
 		 97 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  74.19 
 
 		 97 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  69.89 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  73.68 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  65.96 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  64.44 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  69.15 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  62.22 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  63.33 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  55.79 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  58.89 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  57.14 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  47.37 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  45.56 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  48.42 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  45.98 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  37.08 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  33.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  37.11 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  31.91 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  30.93 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  30.93 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  35.11 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  30.93 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  35.05 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  34.02 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  34.02 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  34.02 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  34.02 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  34.02 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  34.02 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  29.9 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  30.93 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  27.27 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  36.08 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  30.93 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  31.96 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  30.93 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  35.05 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  31.96 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  31.96 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  31.96 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  29.9 
 
 		 98 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  32.99 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  32.99 
 
 		 99 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  28.87 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  30.93 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  28.87 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1994  YCII-related protein  34.02 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  40.79 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  35.05 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>