35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1899 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  35.56 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  34.44 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  35.56 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  35.56 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  35.56 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  35.96 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  37.08 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  36.67 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  33.7 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  33.7 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  30.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  30.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  36.36 
 
 		 93 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  32.22 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  29.55 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  37.78 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  32.22 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  32.18 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  31.63 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  29.59 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  36.67 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  33.68 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  29.59 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  31.63 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  29.59 
 
 		 99 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  29.59 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  29.59 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  30.61 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  27.55 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>