32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1854 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  58.89 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  58.89 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  58.89 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  58.89 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  58.89 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  57.78 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  55.79 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  58.89 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  57.78 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  60.87 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  56.84 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  57.89 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  51.11 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  51.11 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  56.84 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  52.81 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  50 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  48.89 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  43.96 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  40.66 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  37.63 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  37.08 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  36.05 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  32.22 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  32.98 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  33.33 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  34.12 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  30.38 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  28.09 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  37.65 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  33 
 
 		 101 aa  40  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>