98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1029 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  83 
 
 		 100 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  54.55 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  49.49 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  55.56 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  48.94 
 
 		 95 aa  93.2  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  47.42 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  47.42 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  47.42 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  47.87 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  48.42 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  45.74 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  47.87 
 
 		 97 aa  83.6  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  47.25 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  49.47 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  46.24 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  45.16 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  45.16 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  47.87 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  40.66 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  43.68 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  34.41 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  39.77 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  34.44 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  38.37 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  38.64 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2261  YciI-like protein  36.36 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.0746903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1466  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  50.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00060378  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  35.87 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1233  YCII-related  33.67 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000791191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  39.08 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  34.48 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1639  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2926  YciI-like protein  32.95 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  34.44 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1514  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00336778  normal  0.766184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1716  YciI-like protein  32.94 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1448  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  38.89 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2195  YCII-related protein  32.18 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003073  protein yciI  34.09 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.307697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3036  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1504  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.244911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  30.61 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2138  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  32.63 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02294  hypothetical protein  35.63 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1987  YciI-like protein  33.75 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000630595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  32.95 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0666  YCII-related domain protein  34.48 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  29.55 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  32.95 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2180  YCII-related protein  36.73 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0815  YCII-related  34.48 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3398  YCII-related  37.5 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000326779  normal  0.427283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02770  YciI-like protein  30.68 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1729  YCII-related protein  35.96 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3791  YciI-like protein  30.68 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000137608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1399  YciI-like protein  35.63 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.278686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1879  YCII-related  35.29 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1669  YciI-like protein  34.09 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000851056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  30.68 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1738  YciI-like protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000940288  normal  0.0139012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01235  hypothetical protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.947238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2397  YCII-related protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00577394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01225  predicted enzyme  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1420  YciI-like protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0374625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1881  YciI-like protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2376  YciI-like protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115625  hitchhiker  0.0000012139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  35.16 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1530  hypothetical protein  33.71 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0321161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1360  YciI-like protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1010  YCII-related  30.68 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000895007  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15620  YCII-related domain protein  31.63 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0167748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1879  YciI-like protein  32.94 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1833  YciI-like protein  32.97 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.855778  normal  0.363784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2294  YCII-related protein  28.57 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0718  YciI-like protein  37.21 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.532819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  34.07 
 
 		 99 aa  40.8  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1953  YCII-related protein  35.42 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1410  YciI-like protein  28.57 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0448344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4502  YciI-like protein  28.57 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  29.59 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  29.59 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1306  YciI-like protein  30.68 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000114962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  31.63 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  42.55 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  28.41 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>