57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1054 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1054  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0916  YciI-like protein  71.43 
 
 		 100 aa  141  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1952  YciI-like protein  74.49 
 
 		 98 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  0.569612 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1720  YciI-like protein  69.07 
 
 		 97 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6359  YciI-like protein  69.07 
 
 		 97 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1540  YciI-like protein  70.97 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1734  YciI-like protein  69.07 
 
 		 97 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864642  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1641  YciI-like protein  68.82 
 
 		 95 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1642  YciI-like protein  67.74 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0849048  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2132  YciI-like protein  65.96 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5012  YciI-like protein  66.67 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  0.177279 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2076  YciI-like protein  64.89 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1854  YciI-like protein  57.78 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2312  YciI-like protein  65.98 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1100  YciI-like protein  51.52 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1461  YciI-like protein  56.67 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  56.67 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2487  YciI-like protein  55.56 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1698  YciI-like protein  57.95 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1029  YciI-like protein  49.49 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2283  YCII-related domain superfamily protein  48.89 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295956  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32655  predicted protein  43.18 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000150208  normal  0.391035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4908  YCII-related protein  46.51 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1899  YCII-related protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47865  predicted protein  35.87 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.467405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  34.83 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0705  YCII-related  33.67 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  30.53 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1459  YCII-related protein  36.17 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  32.26 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1590  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.818061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2112  YCII-related  30.3 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000414842  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1408  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1865  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1928  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1871  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.737215  normal  0.822939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2288  YciI-like protein  32.99 
 
 		 98 aa  42  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.896099  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2262  YciI-like protein  35.11 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1415  YCII-related  31.87 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000050169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3588  YciI-like protein  32.65 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.324213  normal  0.960338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2026  YCII-like protein  30.12 
 
 		 89 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  28.57 
 
 		 192 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  31.25 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0586  YciI-like protein  34.34 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  29.59 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2386  hypothetical protein  31.63 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2688  YCII-related  35.63 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  31.03 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2201  YciI-like protein  29.76 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.187496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  31.03 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2019  YCII-related  33.67 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0263294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2671  hypothetical protein  38.89 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1808  hypothetical protein  31.63 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  34.07 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  31.18 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  31.18 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2848  YCII-related protein  28 
 
 		 128 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413874  normal  0.43618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>