39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7466 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5879  YCII-related protein  58.46 
 
 		 195 aa  210  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  41.49 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  37.04 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  33.7 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4138  YciI-like protein  32.58 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  32.22 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  34.07 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  36.9 
 
 		 90 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1484  YCII-related  33.71 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  33.33 
 
 		 98 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  27.96 
 
 		 103 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  31.52 
 
 		 90 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  32.98 
 
 		 103 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  32.14 
 
 		 90 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  32.14 
 
 		 90 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  31.91 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  33.71 
 
 		 98 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  30.85 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  31.91 
 
 		 103 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0349  YCII-related  29.41 
 
 		 93 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117394  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  28.24 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0863  YciI-like protein  33.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  29.35 
 
 		 94 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1964  YciI-like protein  31.11 
 
 		 98 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  29.35 
 
 		 90 aa  44.7  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2851  YCII-related protein  30.77 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  29.79 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4760  YCII-related  31.25 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0861081  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  27.96 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1645  hypothetical protein  31.96 
 
 		 100 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.290819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3205  YciI-like protein  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1053  YCII-related  28.57 
 
 		 99 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2835  YCII-related  31.63 
 
 		 99 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  28.57 
 
 		 100 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  27.55 
 
 		 98 aa  42  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2316  YCII-related domain-containing protein  27.55 
 
 		 100 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1421  YciI-like protein  30.61 
 
 		 99 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>