34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5729 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5729  YciI-like protein  100 
 
 		 98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.714875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2916  YciI-like protein  34.78 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0990544  normal  0.0892164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2936  YCII-related  35.16 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  30 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  30.38 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1511  YciI-like protein  36.23 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0163  YciI-like protein  36.23 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3413  YCII-related domain protein  30.43 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  27.78 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  26.67 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  26.67 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  26.67 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  26.67 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  30.77 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2083  YCII-related protein  29.87 
 
 		 188 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  26.09 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3572  YciI-like protein  30.11 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.689182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  25.56 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1145  YciI-like protein  37.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  30.43 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1947  YciI-like protein  34.83 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2148  YciI-like protein  34.83 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.432315  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2057  YCII-related  34.83 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2000  YCII-related  32.1 
 
 		 91 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1269  YciI-like protein  32.65 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1699  YciI-like protein  29.87 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2831  YciI-like protein  27.17 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  28.4 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2417  YciI-like protein  39.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.384464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2736  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000268578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2714  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0349915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2815  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000129416  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1650  YciI-like protein  37.5 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239364  hitchhiker  0.0000000000431009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>