32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0094 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0094  YCII-related protein  100 
 
 		 107 aa  223  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3760  YciI-like protein  32.1 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0330  YciI-like protein  31.71 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5217  YCII-related  32.32 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.967881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1508  YciI-like protein  38.36 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4679  YciI-like protein  31.76 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189989  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2736  hypothetical protein  32.58 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0209633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3379  YCII-related  31.31 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3906  YCII-related domain-containing protein  34.07 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3941  YciI-like protein  34.07 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0697626  normal  0.0807548 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6069  YCII-related protein  30 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4084  YCII-related  31.46 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0037  YCII-related  32.53 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3433  YCII-related  31.46 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5625  YCII-related  30.34 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1871  YCII-related  32 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1442  YCII-related  39.06 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0822188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1804  YCII-related  35.59 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0682479  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6318  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3336  YciI-like protein  29.35 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1511  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1115  YciI-like protein  29.07 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.176684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2012  YCII-related  37.1 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00711302  hitchhiker  0.00184291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1912  YCII-related  38.82 
 
 		 94 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2451  YCII-related  37.1 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1342  YCII-related  24.42 
 
 		 94 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2335  YCII-related  37.1 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.809266  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2107  YCII-related  32 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.951624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6976  hypothetical protein  38.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1911  YCII-related  34.18 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4078  YCII-related  26.74 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2399  YciI-like protein  30.68 
 
 		 92 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>