More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1436 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
260 aa  481  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.590025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24160  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  83.86 
 
 
292 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.955581  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.43 
 
 
252 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  33.05 
 
 
288 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  32.92 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
281 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
283 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
289 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
362 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
273 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
281 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
256 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
375 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
258 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
286 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  34.16 
 
 
285 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
287 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
286 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
375 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
258 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  25.82 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3455  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.75 
 
 
322 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 
257 aa  99  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
316 aa  98.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.505407  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  25.82 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  25.82 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  26.99 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  26.99 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
284 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  30.91 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.69 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
321 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  31.05 
 
 
266 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
267 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6031  putative ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 
325 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.02 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
321 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443029  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.78 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
259 aa  92  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
254 aa  92  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0180  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
283 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
280 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.296576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.69 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.65 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  28.4 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.665089  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
292 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  34.05 
 
 
492 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  31.61 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  28 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  28.29 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.29 
 
 
453 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.6 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000965537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  28.29 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
532 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  28.29 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
299 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  28.29 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>