More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1884 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
307 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.665089  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.82 
 
 
275 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3454  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.79 
 
 
298 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3459  ABC transporter  39.61 
 
 
288 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
297 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
287 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
287 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0476587  normal  0.305557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
294 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
305 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0181  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
311 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856164  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
305 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  0.0329883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
314 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
302 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
315 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.725502  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6032  putative ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 
285 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.18 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.67 
 
 
249 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
259 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
260 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
282 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  30.47 
 
 
265 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  30.47 
 
 
265 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  30.47 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  32.02 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  30.47 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  29.83 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
286 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
254 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  0.835016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
254 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
249 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
257 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  32.61 
 
 
265 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
257 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  32.79 
 
 
287 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
253 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
268 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  33.48 
 
 
266 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
278 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
260 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
281 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
289 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
256 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  29.26 
 
 
251 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
250 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
281 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
286 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  30.17 
 
 
250 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  30.17 
 
 
250 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  30.17 
 
 
250 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  30.17 
 
 
250 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  32.49 
 
 
279 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
250 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
251 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
268 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  32.89 
 
 
266 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  27.46 
 
 
282 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 
281 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
256 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
265 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  30.17 
 
 
250 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
250 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
261 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
251 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
303 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
251 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
253 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  29.7 
 
 
288 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
375 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
258 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
375 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149558 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
254 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.51 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
258 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>