More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6032 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6032  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
285 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.48 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  0.0329883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91742  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.77 
 
 
305 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856164  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3459  ABC transporter  60.82 
 
 
288 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.43 
 
 
305 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.43 
 
 
302 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.84 
 
 
315 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.725502  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.99 
 
 
297 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.4 
 
 
287 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.19 
 
 
287 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0476587  normal  0.305557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0181  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  58.19 
 
 
311 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.9 
 
 
312 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3454  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.61 
 
 
298 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.68 
 
 
314 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.8 
 
 
309 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.62 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
307 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.665089  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 
275 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
268 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
254 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
273 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
258 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
257 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.48 
 
 
261 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
273 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  36.41 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
250 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
268 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.32 
 
 
284 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  35.68 
 
 
266 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  34.74 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  33.19 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.8 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  32.64 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
258 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
278 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  28.83 
 
 
250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
251 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
256 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.8 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
251 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  28.83 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  28.83 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  28.83 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  28.83 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  30 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  31.28 
 
 
282 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  27.02 
 
 
265 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
260 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
254 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
282 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
272 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  29.34 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
281 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 
257 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
255 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 
255 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
254 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
375 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 
257 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  26.61 
 
 
257 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  26.61 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  26.61 
 
 
265 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  26.61 
 
 
257 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 
257 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
322 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.9 
 
 
302 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
268 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
250 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
288 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
286 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  32.98 
 
 
288 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 
247 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
254 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
272 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
271 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  37.19 
 
 
272 aa  99  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.01 
 
 
265 aa  99  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>