61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1031 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1031  heme exporter protein CcmD  100 
 
 		 77 aa  157  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  50.79 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  46.15 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  46.15 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  46.15 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  46.15 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  46.15 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  44.62 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.102118  unclonable  0.0000000000309082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  53.97 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0223  Heme exporter protein D (CcmD)  44.62 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  44.62 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0464589  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0260  heme exporter protein CcmD  46.03 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  49.21 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  50.79 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  44.62 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4290  heme exporter protein D (CcmD)  41.54 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000529225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  43.55 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03071  heme exporter protein CcmD  43.55 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  44.44 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  40.62 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3253  Heme exporter protein D (CcmD)  41.38 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  39.06 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1957  heme exporter protein D (cytochrome c-type biogenesis protein CcmD)  37.1 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1499  heme exporter protein CcmD  40 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.81257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1390  heme exporter protein D  40 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0392  heme exporter protein CcmD  40 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3994  heme exporter protein D  45.83 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.692189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  37.1 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1380  heme exporter protein CcmD  41.51 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  37.5 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2421  heme exporter protein CcmD  38.57 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  32.86 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  35.71 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  35.09 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  33.87 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0042  Heme exporter protein D (CcmD)  56.25 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1515  heme exporter protein D (CcmD)  38 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  34.55 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  34.55 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  32.14 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  30.36 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02125  cytochrome c biogenesis protein  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2725  heme exporter protein CcmD  35.14 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02084  hypothetical protein  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1461  heme exporter protein CcmD  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3335  heme exporter protein D  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2346  heme exporter protein D  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1452  heme exporter protein CcmD  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3412  Heme exporter protein D (CcmD)  34.33 
 
 		 58 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2497  heme exporter protein D  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2336  heme exporter protein D  34.69 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3390  Heme exporter protein D (CcmD)  33.33 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1543  Heme exporter protein D (CcmD)  31.58 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0743  heme exporter protein D  32.65 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4324  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  31.58 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1211  hypothetical protein  33.8 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284082  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0396  heme ABC transporter, substrate-binding protein (heme exporter protein D)  31.88 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.282236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1869  glutaminyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2435  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.762204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4099  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0037  Heme exporter protein D (CcmD)  47.06 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.987653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>