25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1957 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1957  heme exporter protein D (cytochrome c-type biogenesis protein CcmD)  100 
 
 		 77 aa  159  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1869  glutaminyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  34.85 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  30.77 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1826  cytochrome c biogenesis protein, CcmD  34.43 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.180255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  33.85 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  35.38 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  35.38 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0260  heme exporter protein CcmD  31.82 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.102118  unclonable  0.0000000000309082 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0223  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0464589  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2110  Heme exporter protein D (CcmD)  41.86 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  27.27 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  32.31 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  31.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  36.76 
 
 		 69 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  30.77 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  35.38 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  29.23 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1031  heme exporter protein CcmD  37.1 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>