37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1869 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1869  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 66 aa  139  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  44.44 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  44.44 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  40 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  45.28 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  43.4 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1957  heme exporter protein D (cytochrome c-type biogenesis protein CcmD)  41.67 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  37.7 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  39.62 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4324  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  39.62 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1543  Heme exporter protein D (CcmD)  39.62 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  38.89 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  35.59 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  34.48 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  37.04 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  39.62 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  35.19 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  36.07 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0260  heme exporter protein CcmD  35.48 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.102118  unclonable  0.0000000000309082 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0223  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0464589  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3390  Heme exporter protein D (CcmD)  42.31 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  34.48 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  36.07 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4290  heme exporter protein D (CcmD)  34.43 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000529225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  29.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1826  cytochrome c biogenesis protein, CcmD  36.51 
 
 		 74 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.180255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03071  heme exporter protein CcmD  30.51 
 
 		 73 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0396  heme ABC transporter, substrate-binding protein (heme exporter protein D)  31.67 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.282236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30420  Cytochrome c-type biogenesis protein  42.86 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  29.31 
 
 		 68 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  32.73 
 
 		 68 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>