28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3390 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3390  Heme exporter protein D (CcmD)  100 
 
 		 58 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  82.76 
 
 		 58 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  71.43 
 
 		 58 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  69.64 
 
 		 58 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  67.86 
 
 		 58 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  66.07 
 
 		 58 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1543  Heme exporter protein D (CcmD)  66.07 
 
 		 58 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4324  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  66.07 
 
 		 58 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  64.81 
 
 		 58 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  68.52 
 
 		 58 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  68.52 
 
 		 58 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30420  Cytochrome c-type biogenesis protein  65.91 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0420  heme exporter protein CcmD, putative  42.59 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1826  cytochrome c biogenesis protein, CcmD  44.07 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.180255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  38.6 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3412  Heme exporter protein D (CcmD)  44.83 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2110  Heme exporter protein D (CcmD)  44.64 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1869  glutaminyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2167  Heme exporter protein D (CcmD)  45.45 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  38.6 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  33.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1380  heme exporter protein CcmD  44 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0890  heme exporter protein CcmD  44.9 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0921  heme exporter protein CcmD  44.9 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  36.84 
 
 		 68 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  35.09 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  33.33 
 
 		 65 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>