39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2167 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2167  Heme exporter protein D (CcmD)  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2110  Heme exporter protein D (CcmD)  61.67 
 
 		 73 aa  84  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1826  cytochrome c biogenesis protein, CcmD  63.33 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.180255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2725  heme exporter protein CcmD  37.31 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  42.86 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2421  heme exporter protein CcmD  37.5 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1211  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3388  Heme exporter protein D (CcmD)  35.62 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.813039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0396  heme ABC transporter, substrate-binding protein (heme exporter protein D)  29.51 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.282236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1499  heme exporter protein CcmD  39.06 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.81257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  36.84 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0392  heme exporter protein CcmD  39.06 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1869  glutaminyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1390  heme exporter protein D  39.06 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3390  Heme exporter protein D (CcmD)  39.66 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  36.67 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  35 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  26.98 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  35 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02084  hypothetical protein  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3335  heme exporter protein D  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  30 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  29.51 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2336  heme exporter protein D  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2497  heme exporter protein D  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02125  cytochrome c biogenesis protein  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1461  heme exporter protein CcmD  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1452  heme exporter protein CcmD  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2346  heme exporter protein D  37.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0743  heme exporter protein D  37.25 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  30.65 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  38.33 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3412  Heme exporter protein D (CcmD)  35.71 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1957  heme exporter protein D (cytochrome c-type biogenesis protein CcmD)  30.16 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  38.33 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  30.65 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  35 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30420  Cytochrome c-type biogenesis protein  55.17 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  29.31 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>