46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0396 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0396  heme ABC transporter, substrate-binding protein (heme exporter protein D)  100 
 
 
70 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.282236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  48.39 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3253  Heme exporter protein D (CcmD)  45.61 
 
 
78 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2725  heme exporter protein CcmD  36.36 
 
 
73 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2421  heme exporter protein CcmD  36.36 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  40.58 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  37.88 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  37.88 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  37.88 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  37.88 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  37.88 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0260  heme exporter protein CcmD  36.36 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03071  heme exporter protein CcmD  37.1 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  36.36 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.102118  unclonable  0.0000000000309082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  36.36 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0464589  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0223  Heme exporter protein D (CcmD)  36.36 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00474727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  36.36 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  38.46 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  39.13 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  34.92 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  36.92 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  36.92 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3388  Heme exporter protein D (CcmD)  41.3 
 
 
78 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.813039  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  34.92 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  38.71 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  33.33 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4099  hypothetical protein  35.42 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2435  hypothetical protein  35.42 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.762204 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1499  heme exporter protein CcmD  36.67 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.81257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4290  heme exporter protein D (CcmD)  39.29 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000529225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0392  heme exporter protein CcmD  36.67 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.376555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4324  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  38.71 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  43.14 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1390  heme exporter protein D  36.67 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1543  Heme exporter protein D (CcmD)  38.71 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  40.68 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  31.75 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1380  heme exporter protein CcmD  42.31 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  37.93 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  37.1 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  37.93 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  38.71 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  33.87 
 
 
58 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1869  glutaminyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3412  Heme exporter protein D (CcmD)  34.55 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2167  Heme exporter protein D (CcmD)  31.25 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>