25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3412 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3412  Heme exporter protein D (CcmD)  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  48.21 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  52.94 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  46.55 
 
 		 58 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  46.55 
 
 		 58 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  43.1 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  33.93 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30420  Cytochrome c-type biogenesis protein  51.16 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  41.38 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3390  Heme exporter protein D (CcmD)  44.83 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  44.83 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4290  heme exporter protein D (CcmD)  39.29 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000529225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  41.38 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1543  Heme exporter protein D (CcmD)  41.38 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4324  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  41.38 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  41.38 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  35.71 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0037  Heme exporter protein D (CcmD)  46.15 
 
 		 51 aa  42  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.987653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  40 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  38.18 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  35.71 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0396  heme ABC transporter, substrate-binding protein (heme exporter protein D)  34.55 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.282236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3253  Heme exporter protein D (CcmD)  32.73 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  33.93 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1826  cytochrome c biogenesis protein, CcmD  35.09 
 
 		 74 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.180255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>