30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1380 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1380  heme exporter protein CcmD  100 
 
 		 62 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1515  heme exporter protein D (CcmD)  70.97 
 
 		 62 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3994  heme exporter protein D  48.15 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.692189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0042  Heme exporter protein D (CcmD)  63.89 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1367  heme exporter protein D  46.55 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0420  heme exporter protein CcmD, putative  47.92 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  44.23 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1211  hypothetical protein  38.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4324  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  46 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3893  heme exporter protein CcmD  46 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00817898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1543  Heme exporter protein D (CcmD)  46 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  44.23 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  43.4 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0396  heme ABC transporter, substrate-binding protein (heme exporter protein D)  42.31 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.282236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  42.86 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1547  hypothetical protein  48.39 
 
 		 51 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.594579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  42.59 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  41.51 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  60.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  45.28 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  45.28 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  38.98 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3390  Heme exporter protein D (CcmD)  44 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  51.43 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  34.43 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  34.43 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  34.43 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  34.43 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  37.04 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  38.78 
 
 		 68 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>