16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1367 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1367  heme exporter protein D  100 
 
 		 62 aa  123  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3994  heme exporter protein D  40 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.692189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1380  heme exporter protein CcmD  46.55 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1515  heme exporter protein D (CcmD)  52 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0042  Heme exporter protein D (CcmD)  52.5 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2278  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD  37.1 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  42.86 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0420  heme exporter protein CcmD, putative  36.73 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1211  hypothetical protein  36.07 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  33.96 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  32.69 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  32.69 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  32.69 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1547  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.594579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  40.38 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  30.77 
 
 		 68 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>