More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0894 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  100 
 
 
295 aa  611  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2958  ISCps3, transposase orfB  98.98 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0431063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  47.42 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  47.42 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  47.42 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  47.42 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  47.43 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.45 
 
 
277 aa  225  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  41.94 
 
 
291 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  40.38 
 
 
272 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.85 
 
 
270 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.85 
 
 
270 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  37.06 
 
 
286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  37.1 
 
 
286 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 
289 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  36.6 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  36.6 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  36.6 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  36.6 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  36.6 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  36.75 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  36.75 
 
 
280 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  36.75 
 
 
280 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  38.58 
 
 
278 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  34.8 
 
 
281 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 
289 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  35 
 
 
291 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 
289 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  35.11 
 
 
286 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  35.11 
 
 
286 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  35.11 
 
 
286 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  35.11 
 
 
286 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  35.11 
 
 
286 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  35.93 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  35.93 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  36.24 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.88 
 
 
286 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  36.88 
 
 
279 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.88 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.88 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.88 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.88 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  34.93 
 
 
286 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  37.74 
 
 
279 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  34.4 
 
 
302 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  36.19 
 
 
274 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  34.4 
 
 
293 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04480  Integrase catalytic region  42.92 
 
 
291 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  34.04 
 
 
302 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  34.04 
 
 
293 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
285 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  36.01 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  36.01 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  36.98 
 
 
279 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  37.74 
 
 
279 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  36.01 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  36.01 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  37.55 
 
 
269 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  37.55 
 
 
269 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>