More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2958 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2958  ISCps3, transposase orfB  100 
 
 
295 aa  611  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0431063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  98.98 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  46.74 
 
 
295 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  46.74 
 
 
295 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  46.74 
 
 
295 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  46.74 
 
 
295 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  46.64 
 
 
266 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.7 
 
 
277 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  41.22 
 
 
291 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  39.62 
 
 
272 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  39.11 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  39.11 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  36.71 
 
 
286 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  36.36 
 
 
286 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  36.36 
 
 
286 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  36.75 
 
 
286 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 
386 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  36.33 
 
 
386 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35.85 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35.85 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35.85 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35.85 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35.85 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  34.43 
 
 
281 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  38.2 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  34.64 
 
 
291 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  36.04 
 
 
280 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  36.04 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  36.04 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
289 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  34.75 
 
 
286 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  34.75 
 
 
286 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  34.75 
 
 
286 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  35.89 
 
 
288 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  34.75 
 
 
286 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  35.93 
 
 
279 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  35.93 
 
 
279 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  34.75 
 
 
286 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  36.88 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.52 
 
 
286 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.52 
 
 
286 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.52 
 
 
286 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.52 
 
 
286 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.52 
 
 
286 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  37.36 
 
 
279 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
280 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  35.82 
 
 
280 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  37.55 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>