277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01470 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  100 
 
 		 743 aa  1528    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  46.9 
 
 		 650 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  35.66 
 
 		 529 aa  302  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  58.88 
 
 		 653 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  47.59 
 
 		 378 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 717 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.96 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  34.08 
 
 		 638 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  30.58 
 
 		 611 aa  100  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  33.72 
 
 		 560 aa  95.1  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  30 
 
 		 562 aa  94  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 		 669 aa  88.6  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  31.32 
 
 		 597 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  29.12 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  36.14 
 
 		 360 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  32.3 
 
 		 379 aa  67  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  29.29 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  29.88 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  32.8 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.27 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  29.27 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  31.71 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  29.81 
 
 		 374 aa  62  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  24.48 
 
 		 521 aa  62  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  29.76 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  25.74 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  35.4 
 
 		 281 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.15 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  33.64 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  28.75 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.54 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  26.58 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  26.58 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  29.05 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  40.98 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.67 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  33.66 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.57 
 
 		 291 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  40.98 
 
 		 293 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  41.94 
 
 		 279 aa  56.6  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  38.1 
 
 		 197 aa  57  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  30.19 
 
 		 260 aa  56.2  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  31.06 
 
 		 324 aa  56.6  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  30.9 
 
 		 256 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  41.38 
 
 		 276 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  44.26 
 
 		 277 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  43.94 
 
 		 285 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  31.87 
 
 		 261 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27.78 
 
 		 281 aa  55.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  27.44 
 
 		 313 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  27.44 
 
 		 313 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  39.68 
 
 		 271 aa  54.7  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  27.72 
 
 		 323 aa  54.3  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  29.19 
 
 		 316 aa  54.3  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  30.23 
 
 		 258 aa  54.3  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  28.57 
 
 		 284 aa  54.3  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  32 
 
 		 307 aa  54.3  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  25.41 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  36.78 
 
 		 315 aa  53.5  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  38.57 
 
 		 287 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  24.12 
 
 		 266 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  25.41 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  26.98 
 
 		 313 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  25.41 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  26.67 
 
 		 327 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  34.41 
 
 		 328 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  27.61 
 
 		 322 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  25.41 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  38.57 
 
 		 287 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  29.19 
 
 		 292 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  39.34 
 
 		 341 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  30.22 
 
 		 261 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  29.46 
 
 		 313 aa  52.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  29.46 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  30.69 
 
 		 314 aa  52.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  29.73 
 
 		 313 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  26.98 
 
 		 313 aa  52  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0212  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.48 
 
 		 207 aa  52  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  26.83 
 
 		 270 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  37.18 
 
 		 305 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  29.73 
 
 		 312 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0639  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.23 
 
 		 214 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  29.73 
 
 		 312 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  26.82 
 
 		 319 aa  51.6  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  33 
 
 		 307 aa  51.6  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  41.38 
 
 		 315 aa  51.6  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  36.84 
 
 		 320 aa  52  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  28.57 
 
 		 313 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  29.03 
 
 		 283 aa  51.6  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  26.82 
 
 		 319 aa  51.6  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  41.38 
 
 		 318 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  41.38 
 
 		 318 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.1 
 
 		 298 aa  51.6  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  41.07 
 
 		 294 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  29.46 
 
 		 312 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  41.07 
 
 		 294 aa  51.2  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  33.8 
 
 		 277 aa  50.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  28.74 
 
 		 254 aa  50.8  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  43.1 
 
 		 319 aa  50.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>