More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06180 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  100 
 
 		 638 aa  1298    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  29.26 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  26.48 
 
 		 378 aa  134  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  27.85 
 
 		 529 aa  133  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  36.11 
 
 		 743 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  37.5 
 
 		 653 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  30.7 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 		 669 aa  67  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  27.57 
 
 		 560 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  28.4 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  27.81 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  42.03 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  29.77 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  25.44 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  27.38 
 
 		 534 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  28.66 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  31.36 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  28.66 
 
 		 388 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  27.32 
 
 		 439 aa  55.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  41.79 
 
 		 447 aa  55.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  34.04 
 
 		 438 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  27.81 
 
 		 384 aa  54.3  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  32.14 
 
 		 470 aa  54.3  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  40 
 
 		 324 aa  53.9  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3073  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.25 
 
 		 217 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.574701  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  36.17 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  39.71 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  24.39 
 
 		 271 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  27.61 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  40.98 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  44.64 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  41.67 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  41.43 
 
 		 305 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  31.91 
 
 		 339 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  30.22 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  39.73 
 
 		 436 aa  53.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  38.75 
 
 		 490 aa  52.4  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  32.94 
 
 		 282 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  41.1 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  43.86 
 
 		 495 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  27.27 
 
 		 262 aa  51.6  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  25.97 
 
 		 266 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  27.27 
 
 		 262 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  41.18 
 
 		 441 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3702  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.85 
 
 		 217 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  36.14 
 
 		 455 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  35.42 
 
 		 438 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  35.42 
 
 		 438 aa  51.2  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  40.3 
 
 		 436 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  51.22 
 
 		 437 aa  50.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  50.8  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  40.3 
 
 		 436 aa  50.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2013  GTP-binding protein EngA  40.68 
 
 		 437 aa  50.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  31.37 
 
 		 490 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 		 436 aa  50.4  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.75 
 
 		 235 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  28.49 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  43.33 
 
 		 436 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  24.37 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.33 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  43.1 
 
 		 436 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.57 
 
 		 274 aa  50.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  28.35 
 
 		 435 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  44.83 
 
 		 436 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  30.34 
 
 		 284 aa  50.1  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  37.65 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  39.76 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2629  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.5 
 
 		 219 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  46.81 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  42.11 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  46.81 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1841  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.56 
 
 		 220 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  26.97 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  39.66 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3329  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.83 
 
 		 244 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.330314  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  32.98 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  28.45 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0305  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.55 
 
 		 216 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0319802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  37.14 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  37.7 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  31.68 
 
 		 467 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  46.81 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  38.57 
 
 		 436 aa  49.7  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  36.92 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  39.34 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 436 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  43.55 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>