222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15435 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  100 
 
 
611 aa  1249    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  28.18 
 
 
650 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  29.66 
 
 
529 aa  147  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  31.87 
 
 
378 aa  143  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  30.58 
 
 
743 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  23.57 
 
 
638 aa  96.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  33.33 
 
 
653 aa  96.3  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 
669 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  44.44 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  42.22 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  34.15 
 
 
560 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  24.16 
 
 
562 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  41.46 
 
 
271 aa  60.1  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  24.55 
 
 
323 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  40.68 
 
 
534 aa  59.3  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  39.68 
 
 
521 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  25.71 
 
 
319 aa  57.4  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  46.77 
 
 
324 aa  57.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  40.35 
 
 
717 aa  57  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  40.98 
 
 
260 aa  57  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  33.33 
 
 
544 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  35.23 
 
 
278 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  31.33 
 
 
258 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  38.71 
 
 
307 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  40.35 
 
 
443 aa  54.3  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  27.62 
 
 
341 aa  53.9  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  38.03 
 
 
315 aa  53.9  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0596  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.37 
 
 
207 aa  53.9  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.502995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  35.06 
 
 
262 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  35.06 
 
 
262 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  43.1 
 
 
197 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  35.71 
 
 
294 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  34.72 
 
 
315 aa  52.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  36.71 
 
 
287 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  31.43 
 
 
283 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  38.1 
 
 
319 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  35.71 
 
 
294 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  39.68 
 
 
328 aa  53.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  36.49 
 
 
307 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  38.1 
 
 
319 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  36.71 
 
 
287 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  36.84 
 
 
318 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0868  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.1 
 
 
195 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  36.84 
 
 
318 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  38.1 
 
 
322 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  39.06 
 
 
319 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
312 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  42.31 
 
 
285 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  25.93 
 
 
317 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  34.29 
 
 
279 aa  51.6  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.95 
 
 
282 aa  51.2  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  33.77 
 
 
291 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  35.53 
 
 
284 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  34.12 
 
 
287 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2742  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.1 
 
 
207 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.313609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  39.34 
 
 
305 aa  50.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3183  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.94 
 
 
198 aa  50.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  36.76 
 
 
313 aa  50.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  34.78 
 
 
314 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.09 
 
 
298 aa  50.8  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  33.8 
 
 
271 aa  50.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  38.71 
 
 
304 aa  50.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  37.5 
 
 
330 aa  50.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  33.77 
 
 
293 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  41.07 
 
 
288 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  35.29 
 
 
312 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  35.29 
 
 
312 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1652  GTP-binding protein  38.98 
 
 
219 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2867  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.24 
 
 
216 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  40.32 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  34.85 
 
 
292 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  39.29 
 
 
292 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  32.05 
 
 
316 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2681  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.24 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.768728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  37.5 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  23.33 
 
 
292 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2672  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  36.76 
 
 
216 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922288  normal  0.0302457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  24.81 
 
 
511 aa  49.3  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  35.29 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  35.29 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  40.35 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2774  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.24 
 
 
216 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4052  GTP-binding protein, HSR1-related  37.1 
 
 
198 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  35.29 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  41.07 
 
 
289 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  34.72 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  34.57 
 
 
270 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  40.35 
 
 
388 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  37.1 
 
 
280 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  40.35 
 
 
374 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  25.81 
 
 
511 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  30.77 
 
 
329 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  38.89 
 
 
277 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>