More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0104 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  98.91 
 
 		 184 aa  360  9e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  98.37 
 
 		 184 aa  358  3e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000207566  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  70.49 
 
 		 186 aa  270  9e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000967122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  53.71 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  54.79 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000117252  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  54.11 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  57.48 
 
 		 135 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.44 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.4 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.09 
 
 		 301 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  39.25 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.22 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 431 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  53.12 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.12 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  58.06 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.26 
 
 		 283 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 		 366 aa  71.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.82 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  38.26 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.49 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  38.26 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.49 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.49 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  44.3 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  38.26 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  37.21 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  47.95 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  29.55 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  29.38 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.27 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  29.17 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  29.69 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.26 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  37.82 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  29.55 
 
 		 348 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  29.17 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3417  biopolymer transport protein ExbB  26.84 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.39 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  29.02 
 
 		 323 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02880  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0692  tonB-system energizer ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  38.21 
 
 		 320 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  28.88 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  29.57 
 
 		 326 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3434  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4317  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  38.21 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3475  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3291  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  51.56 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02830  hypothetical protein  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  47.56 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0689  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  51.56 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.91 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.79 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  35.07 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  50 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  38.21 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  42.39 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5985  tonB-system energizer ExbB  36.97 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.70641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  53.23 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  40.21 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  51.61 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  37.82 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  37.82 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.44 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  51.61 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  53.23 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  52.38 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3342  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3333  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  35.85 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3407  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.512684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3413  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3508  biopolymer transport protein ExbB  37.04 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  31.35 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  51.61 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  51.61 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  43.53 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0375  TonB-system energizer ExbB type-1  26.07 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>