More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0197 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000967122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  71.04 
 
 		 184 aa  270  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000207566  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  70.49 
 
 		 184 aa  270  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  70.49 
 
 		 184 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  56.28 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000117252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  51.67 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 		 195 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  55.41 
 
 		 155 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 		 135 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.43 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  30.85 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  44.09 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.24 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  45.45 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.58 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.58 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.89 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.78 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.85 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  38.26 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  42.71 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  27.27 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  46.43 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  39.62 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  39.62 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  51.47 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.16 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  42.86 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.16 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  40.43 
 
 		 355 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  41.24 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  37.25 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  38.38 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  40 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.44 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.86 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  39.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  39.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  39.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  39.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.45 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  44.87 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  43.75 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  26.77 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  26.77 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  41.67 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1131  tonB-system energizer ExbB  25.85 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  40.4 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  47.44 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  40.4 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  40.4 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.5 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  41.18 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.83 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  27.87 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.82 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  41.18 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  39.45 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  34.13 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.07 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  38.53 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  38.53 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  34.13 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  46.25 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1267  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 		 318 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137669  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  53.23 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.48 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2305  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 		 320 aa  64.3  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.605743  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  35.71 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  27.67 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  31.48 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.09 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.61 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  28.26 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  38.53 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.22 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.61 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  28.26 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  38.53 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  27.67 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  27.87 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>