More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1523 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  100 
 
 
199 aa  390  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000117252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  62.83 
 
 
192 aa  246  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.2 
 
 
195 aa  228  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  73.33 
 
 
155 aa  224  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  73.68 
 
 
135 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  57.38 
 
 
186 aa  193  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000967122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.38 
 
 
184 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000207566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.38 
 
 
184 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  55.85 
 
 
184 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.16 
 
 
188 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
288 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  35.2 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.64 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  45.05 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  43.18 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  36.72 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  58.73 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.72 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  31.49 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  36.76 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  37.93 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.73 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.73 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  48.72 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  34.51 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.44 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  40 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
400 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  39.5 
 
 
248 aa  72  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.18 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.18 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.18 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.18 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  41.84 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  37.93 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  48.1 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  44.09 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  33.75 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  49.38 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  52 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  52 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.27 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  52 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  35 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  45.12 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  52 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  52 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  55.56 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  27.19 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  42.45 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  41.84 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.87 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.87 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.76 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.24 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.83 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  40 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.76 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.18 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.45 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  40.86 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0235  tonB-system energizer ExbB  43.53 
 
 
355 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.700066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  44.87 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  37.38 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.68 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.68 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.68 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
251 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  43.04 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.68 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.67 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  43.53 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  37.82 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>