59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1721 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1721  putative periplasmic protein  100 
 
 		 305 aa  588  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.997159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1933  putative periplasmic protein  34.18 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0863  carbon-nitrogen family hydrolase  34.59 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1014  periplasmic protein NapL  32.9 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0443  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0805  napL protein  30.23 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0698108  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0875  NapL  29.9 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1156  putative periplasmic protein  31.53 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.4354  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0729  WD-40 repeat protein  23.58 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1519  periplasmic nitrate reductase assembly and/or export protein NapL  28.85 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.69 
 
 		 1652 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  21.66 
 
 		 696 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 		 1161 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1510 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  20.67 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 		 1481 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.43 
 
 		 687 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.25 
 
 		 677 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 		 947 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 		 1236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1858 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1553 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1363 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1477 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  20.69 
 
 		 1208 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.28 
 
 		 740 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.05 
 
 		 589 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 		 1411 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  24.82 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  24.82 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 		 1247 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 		 1163 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.07 
 
 		 636 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 505 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.62 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.62 
 
 		 930 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  26.83 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  20.81 
 
 		 1523 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  19.89 
 
 		 1474 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 		 1161 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1304 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.45 
 
 		 1164 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.16 
 
 		 692 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.28 
 
 		 778 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25 
 
 		 742 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  20.43 
 
 		 1878 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.33 
 
 		 1190 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.58 
 
 		 1760 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  21.76 
 
 		 608 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  20.09 
 
 		 914 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  23.71 
 
 		 597 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.75 
 
 		 1686 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.02 
 
 		 596 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  21.13 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.05 
 
 		 675 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.49 
 
 		 757 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1552 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.67 
 
 		 1656 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 		 1348 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>