45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0863 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0863  carbon-nitrogen family hydrolase  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1933  putative periplasmic protein  70.1 
 
 		 311 aa  454  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628832  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1014  periplasmic protein NapL  34.08 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1721  putative periplasmic protein  34.71 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.997159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0729  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0443  WD-40 repeat protein  28.03 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0805  napL protein  30.03 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0698108  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0875  NapL  30.03 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1519  periplasmic nitrate reductase assembly and/or export protein NapL  29.49 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1156  putative periplasmic protein  24.91 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.4354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.55 
 
 		 1208 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.26 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.85 
 
 		 687 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.46 
 
 		 947 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.99 
 
 		 1652 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.38 
 
 		 677 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1236 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.96 
 
 		 740 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  22.56 
 
 		 1878 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.04 
 
 		 676 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.63 
 
 		 930 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.2 
 
 		 464 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.51 
 
 		 1363 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25 
 
 		 1364 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.1 
 
 		 742 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 1221 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.99 
 
 		 1262 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1196 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.33 
 
 		 757 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 		 578 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1714 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.65 
 
 		 1163 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  20.54 
 
 		 1474 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 		 1760 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  20.33 
 
 		 1213 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0958  WD-40 repeat-containing protein  21.28 
 
 		 580 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.36 
 
 		 898 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.07 
 
 		 842 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  23.28 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 		 840 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 1190 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.25 
 
 		 1686 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.56 
 
 		 657 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  22.04 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>