43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0729 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0729  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 315 aa  646    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1519  periplasmic nitrate reductase assembly and/or export protein NapL  37.37 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0443  WD-40 repeat protein  36.58 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1933  putative periplasmic protein  29.49 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0863  carbon-nitrogen family hydrolase  27.89 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1014  periplasmic protein NapL  27.61 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0805  napL protein  27.3 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0698108  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0875  NapL  26.95 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1721  putative periplasmic protein  23.58 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.997159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.01 
 
 		 947 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.82 
 
 		 696 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.45 
 
 		 1213 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  22.75 
 
 		 1208 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1156  putative periplasmic protein  22.54 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.4354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.54 
 
 		 1652 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.73 
 
 		 1684 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.62 
 
 		 930 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.24 
 
 		 443 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1196 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 		 1878 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.9 
 
 		 1760 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.97 
 
 		 677 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  23.2 
 
 		 1311 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  21.4 
 
 		 1242 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.41 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  22.79 
 
 		 742 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  28.67 
 
 		 790 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.13 
 
 		 1686 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.82 
 
 		 1205 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 1221 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07990  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  23.22 
 
 		 465 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  21.16 
 
 		 728 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 		 1236 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  23.72 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1474 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07310  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  19.48 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  34.83 
 
 		 371 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  34.83 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.01 
 
 		 1188 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.41 
 
 		 664 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0003  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.767004 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  20.32 
 
 		 577 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>