31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1933 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1933  putative periplasmic protein  100 
 
 		 311 aa  620  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0863  carbon-nitrogen family hydrolase  70.95 
 
 		 311 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1014  periplasmic protein NapL  35.05 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1721  putative periplasmic protein  34.18 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.997159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0729  WD-40 repeat protein  29.49 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0443  WD-40 repeat protein  29.56 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0875  NapL  30.99 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0805  napL protein  30.63 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0698108  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1519  periplasmic nitrate reductase assembly and/or export protein NapL  30.77 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1156  putative periplasmic protein  27.37 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.4354  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.81 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.34 
 
 		 947 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1208 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.14 
 
 		 696 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.57 
 
 		 742 aa  52.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 		 1686 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.19 
 
 		 1364 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  24.54 
 
 		 790 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.56 
 
 		 1652 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1196 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.79 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1041 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  21.32 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  24.11 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1807 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1474 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  22.86 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.07 
 
 		 1711 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>