14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1014 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1014  periplasmic protein NapL  100 
 
 		 308 aa  596  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0875  NapL  49.84 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0805  napL protein  49.84 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0698108  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1933  putative periplasmic protein  35.05 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0863  carbon-nitrogen family hydrolase  34.84 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0729  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1519  periplasmic nitrate reductase assembly and/or export protein NapL  29.01 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1721  putative periplasmic protein  32.9 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.997159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0443  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1156  putative periplasmic protein  32.99 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.4354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 		 947 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.37 
 
 		 664 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.74 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  36.76 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>