247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1722 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1722  RNA chaperone Hfq  100 
 
 		 243 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.057332  hitchhiker  0.00002496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1453  RNA chaperone Hfq  89.39 
 
 		 196 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1413  RNA chaperone Hfq  88.89 
 
 		 196 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1507  RNA chaperone Hfq  88.27 
 
 		 192 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  hitchhiker  0.0000424757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1051  host factor Hfq  88.27 
 
 		 192 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1531  RNA chaperone Hfq  88.27 
 
 		 192 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4671  host factor Hfq  86.73 
 
 		 192 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2532  hfq protein  71.43 
 
 		 208 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1038  hfq protein  69.86 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00601589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1799  putative RNA chaperone Hfq  69.59 
 
 		 216 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00326257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1954  Hfq protein  69.59 
 
 		 216 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000604734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1768  hfq protein  69.41 
 
 		 214 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00010879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0127  hfq protein  66.96 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1778  putative RNA chaperone Hfq  63.6 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000070554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1280  hfq protein  68.22 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000558443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1665  RNA chaperone Hfq  58.47 
 
 		 172 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.655904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2786  nucleoprotein, Hfg, host factor I like protein  57.38 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600231  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1711  RNA chaperone Hfq  55.74 
 
 		 150 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1493  host factor Hfq  36.26 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0431  RNA-binding protein Hfq  42.86 
 
 		 102 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000376356  unclonable  0.0000000212811 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0921  RNA-binding protein Hfq  58.93 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0821  RNA chaperone Hfq  58.93 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2590  host factor Hfq  58.93 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.104665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3721  RNA-binding protein Hfq  42.7 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000253579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04039  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0456989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3821  RNA chaperone Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000750776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4722  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3841  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  unclonable  0.00000000853498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5688  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0502195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4639  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0355  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0252672  hitchhiker  0.00389143 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4703  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.912238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4643  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4629  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4414  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4730  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04001  hypothetical protein  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4779  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00124447  normal  0.127412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1471  RNA-binding protein Hfq  48.19 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4758  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0666  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0371951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3919  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3978  RNA chaperone Hfq  55.36 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4894  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.249233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4685  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0070  RNA-binding protein Hfq  57.14 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3653  RNA-binding protein Hfq  53.57 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4770  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2603  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0475975  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3799  RNA-binding protein Hfq  53.57 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00202048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5014  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0484733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0699  RNA-binding protein Hfq  53.57 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0058  RNA-binding protein Hfq  57.14 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1983  hfq protein  57.14 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.562833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4946  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2192  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00649  RNA-binding protein Hfq  48.53 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0803651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1429  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1877  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1991  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.0165954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0492  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00316881  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1286  RNA chaperone Hfq  62.5 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.519898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2302  host factor Hfq  60.71 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232756  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0573  RNA chaperone Hfq  57.14 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174076  hitchhiker  0.000000000517763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1175  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.843427  normal  0.622907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1095  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2184  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1220  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0669  RNA chaperone Hfq  60.71 
 
 		 80 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4942  hfq protein  53.57 
 
 		 86 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1101  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0566  RNA chaperone Hfq  53.57 
 
 		 92 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0286817  normal  0.207792 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0067  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0573116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1340  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07540  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 84 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0572  RNA-binding protein Hfq  53.57 
 
 		 86 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2081  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0916086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5673  RNA-binding protein Hfq  50.7 
 
 		 82 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0523  RNA-binding protein Hfq  53.57 
 
 		 86 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0178415  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0797  RNA chaperone Hfq  53.57 
 
 		 93 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.733569  hitchhiker  0.00597566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0635  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 86 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0651031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5108  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.203051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2222  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.388443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2239  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.245195  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00094  RNA-binding protein Hfq  55.36 
 
 		 87 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1415  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1599  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3205  host factor Hfq  53.57 
 
 		 89 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4341  host factor Hfq  41.57 
 
 		 96 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4170  RNA chaperone Hfq  53.57 
 
 		 94 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0476291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6272  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3540  RNA chaperone Hfq  44.3 
 
 		 92 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1064  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3311  RNA chaperone Hfq  53.57 
 
 		 85 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1745  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 80 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65310  RNA-binding protein Hfq  50.7 
 
 		 82 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1807  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1831  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.781797  normal  0.415294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1468  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859104  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1829  RNA-binding protein Hfq  60.71 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>