32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2401 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2401  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  46.05 
 
 		 417 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1606  Alginate lyase 2  43.16 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139119  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2582  hypothetical protein  28.91 
 
 		 370 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0495255  hitchhiker  0.0081508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  29.89 
 
 		 611 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5256  lyase, putative  30.7 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3057  hypothetical protein  30.8 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0328593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5015  lyase, putative  28.26 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0463  hypothetical protein  27.63 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3520  hypothetical protein  28.99 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3376  lyase, putative  30.9 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41500  putative lyase  27.31 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0508  lyase, putative  27.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3605  lyase, putative  31.42 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  28.33 
 
 		 1556 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31810  alginate lyase  28.72 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49320  hypothetical protein  28.92 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52458  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  29.95 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4213  hypothetical protein  27.94 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2102  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00164411  normal  0.0561114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1666  hypothetical protein  28.16 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.398713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3286  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  25 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00739048  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3645  alginate lyase  29.81 
 
 		 357 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.459698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23960  alginate lyase  27.18 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01238  putative alginate lyase  35 
 
 		 530 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3336  Alginate lyase 2  28.04 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3207  alginate lyase 2  24.46 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2129  alginate lyase 2  23.63 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350709  hitchhiker  0.00000589655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2839  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  36.49 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000472325  normal  0.357499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 1755 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3639  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.43 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0665057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>