28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3336 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3336  Alginate lyase 2  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  39.27 
 
 		 873 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3057  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0328593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1606  Alginate lyase 2  30.77 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139119  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  27.64 
 
 		 1556 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11483  hypothetical protein  26.54 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  30.73 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  30.77 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2102  hypothetical protein  30.45 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00164411  normal  0.0561114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0463  hypothetical protein  29.19 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1666  hypothetical protein  26.97 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.398713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3376  lyase, putative  27.59 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3605  lyase, putative  27.59 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31810  alginate lyase  27.04 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41500  putative lyase  28.46 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3520  hypothetical protein  27.53 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23960  alginate lyase  27.92 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4213  hypothetical protein  25.78 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0508  lyase, putative  26.45 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5256  lyase, putative  25.23 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49320  hypothetical protein  26.11 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52458  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5015  lyase, putative  25 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11528  putative alginate lyase  30.65 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.187327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2582  hypothetical protein  24.3 
 
 		 370 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0495255  hitchhiker  0.0081508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2401  hypothetical protein  28.43 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01238  putative alginate lyase  33.04 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2839  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  27.19 
 
 		 367 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000472325  normal  0.357499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>