109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2970 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2970  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0749065  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1721  hypothetical protein  68.47 
 
 
243 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2681  hypothetical protein  66.18 
 
 
236 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3572  hypothetical protein  62.98 
 
 
246 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.267863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2268  hypothetical protein  65.99 
 
 
276 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4260  hypothetical protein  65.83 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1727  hypothetical protein  65.83 
 
 
246 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3659  hypothetical protein  45.69 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7159  hopanoid-associated phosphorylase  45.64 
 
 
246 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3769  hopanoid-associated phosphorylase  43.15 
 
 
230 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5427  hypothetical protein  41.12 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.103702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3461  hypothetical protein  42.13 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  45.81 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6343  hypothetical protein  43.65 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  42.29 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3244  hopanoid-associated phosphorylase  36.36 
 
 
253 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4136  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7030  hypothetical protein  40.83 
 
 
243 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208747  hitchhiker  0.0000000103187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0013  hypothetical protein  41.04 
 
 
243 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520406  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5503  hypothetical protein  40.35 
 
 
235 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146847  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4950  hypothetical protein  39.77 
 
 
235 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.047214 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5181  hypothetical protein  42.01 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5678  hypothetical protein  42.01 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  hitchhiker  0.00182572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3157  hypothetical protein  41.51 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4557  hypothetical protein  42.01 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0500277  normal  0.141352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0413  hypothetical protein  35.03 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3176  hypothetical protein  40.57 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1128  hypothetical protein  39.08 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1408  hypothetical protein  39.08 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.6284  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3274  hypothetical protein  39.08 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3160  hypothetical protein  39.08 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2393  hypothetical protein  39.08 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2099  hypothetical protein  39.08 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1489  hypothetical protein  38.64 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0020  hypothetical protein  40.24 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2358  hypothetical protein  39.53 
 
 
235 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1824  hypothetical protein  37.58 
 
 
246 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0061  purine phosphorylases family protein 1  42.31 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2555  purine phosphorylase family protein 1  33.59 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1782  hopanoid-associated phosphorylase  33.53 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.481568  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2123  MTA/SAH nucleosidase, putative  33.53 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0811  phosphorylase family protein  34.15 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.120801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1319  purine phosphorylase family protein 1  31.4 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1216  hypothetical protein  29.1 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.057912  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20750  Purine and other phosphorylase-like protein, family 1  37.5 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0825  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.91 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1662  hypothetical protein  29.27 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.2 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2078  nucleoside phosphorylase, putative  31.95 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.47 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.47 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  27.4 
 
 
249 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.63 
 
 
231 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2362  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  28.74 
 
 
466 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.01 
 
 
279 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.01 
 
 
279 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1785  hypothetical protein  26.28 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1757  hypothetical protein  26.28 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  31.94 
 
 
458 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.48 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1055  phosphorylase  31.82 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30.56 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.1 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.65 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30.56 
 
 
459 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30.56 
 
 
459 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30.56 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1743  purine or other phosphorylase family 1  29.17 
 
 
286 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.86 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0485  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.15 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  30.43 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.03 
 
 
228 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0867  purine phosphorylase family protein 1  31.48 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.33 
 
 
258 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781096  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  34.43 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  27.94 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  30.99 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.52 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1322  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.15 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3705  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase, putative  27.4 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1274  purine phosphorylase family protein 1  29.17 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000847137 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0224  MTA/SAH nucleosidase  29.3 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0699  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.77 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.16 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  29.86 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1277  hypothetical protein  27.41 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  27.41 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.84 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5712  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  38.89 
 
 
657 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.09 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0400  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  42.86 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.1 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.6 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  26.62 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.57 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.85 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.603402 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0526  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.78 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>